★Banques de données LSDBs et bioinformatique

★Interprétation des variants non classés

L’étude exhaustive de gènes conduit à l’identification de nombreux variants non décrits dont l’effet pathogène ou non est à démontrer.  En effet, il est difficile d’établir à priori l’impact de nombreuses variations introniques, isosémantiques ou faux-sens sur la fonction de la protéine codée, et donc sur leur implication dans la pathologie. Il est pourtant crucial dans le cadre d’un rendu de diagnostic génétique de discriminer les variations causales des variations bénignes. Ainsi, les analyses de ségrégation familiale du variant, de recherche du variant dans des populations contrôles, la compilation des données de la littérature et internes au laboratoire constituent la base de l’interprétation. Cependant, ces méthodes se révèlent souvent insuffisantes et l’utilisation de méthodes d’analyses et de prédictions informatiques apporte un précieux complément d’information. Deux grandes classes d’effets délétères peuvent être distinguées concernant ces variants : les variations introniques, isosémantiques et faux-sens peuvent toutes conduire à un épissage aberrant de l’ARNm alors que les variants faux-sens peuvent par eux-mêmes (c’est à dire par simple modification de la nature d’un acide aminé dans la protéine) altérer la structure et donc la fonction de la protéine. L’utilisation de matrices de prédictions dans un cas, l’étude d’alignements multiples et de structures tridimensionnelles dans l’autre permettent de compléter de manière efficace l’interprétation de ces variants. Il est donc important de continuer à optimiser ce type d’approche, ainsi que de l’étendre à toutes les pathologies qui pourraient en bénéficier.

★Evaluation de l’implication de nouveaux gènes dans les pathologies étudiées au laboratoire

★Evaluation et mise en place de nouvelles approches d’études moléculaires (puces de re-séquençage, SNPage et réarrangements moléculaires)

★Développement d’une activité diagnostique pour les prédispositions génétiques mendéliennes non syndromiques aux anévrismes de l’aorte thoracique et/ou dissections aortiques (AAT/DA)

★Gestion des collections “acides nucléiques et cultures cellulaires” destinés à l’étude des caractéristiques génétiques» dans le cadre de la création du Centre de Ressources Biologiques du CHU de Montpellier

★Création de l'Institut Grégor Mendel