Notre laboratoire de diagnostic s’est spécialisé depuis de nombreuses années dans l’exploration complète des 27 exons du gène CFTR et de leurs séquences flanquantes par les techniques de « balayage » et plus récemment par séquençage en plaque en condition unique. Ces analyses, complétées par la recherche de larges réarrangements, nous permettent d’identifier plus de 97% des mutations responsables de mucoviscidose dans le Sud de la France, région où l’hétérogénéité des populations est génératrice de mutants rares. De nouvelles techniques sont à l’étude afin de diminuer encore le pourcentage de patients pour lesquels les mutations n’ont pû être mises en évidence.
Les techniques de détection associées à l’extrême hétérogénéité allélique de notre région nous ont permis d’identifier pour la première fois de nombreux mutants. La pathogénicité de certains d’entre eux n’est pas prouvée, c’est pourquoi, le laboratoire développe des études épidémiologiques et un programme d’études fonctionnelles en vue de discriminer les mutants délétères des variations non pathogènes.
Les données moléculaires et épidémiologiques accumulées sur cette pathologie depuis 19 ans nous ont conduits à mettre en place un registre d’épidémiologie-LSDB dans la région Languedoc-Roussillon. Le développement de ce registre permettra, après saisie des données cliniques, moléculaires ainsi que des origines géographiques et ethniques des patients, de préciser l’incidence et l’évolution de la mucoviscidose dans cette région méditerranéenne, d’établir la distribution des mutations de cette pathologie, permettant de mieux cibler la recherche de mutants dans une population particulière, de mesurer l’impact des stratégies de santé publique sur l’incidence de la maladie et d’affiner les corrélations phénotpe-génotype grâce à l’outil moléculaire LSDB-UMD dédié au gène CFTR. En effet, l’originalité de cette base de données est d’intégrer toute altération de séquence détectée chez un patient et de reconstruire les haplotypes. Cet outil puissant pourrait permettre d’expliquer, par la mise en évidence d’allèles complexes, des différences phénotypiques observées chez les patients porteurs de génotypes identiques.
Agrément diagnostic prénatal.
Agrément étude des caractéristiques génétiques.
Dépistage néonatal.
Agrément diagnostic préimplantatoire. Anne Girardet
Pour plus d’informations sur la mucoviscidose :
MIM#219700
http://www.orpha.net/data/patho/Pub/fr/Mucoviscidose-FrfrPub.pdf
Equipe diagnostic / recherche clinique :
-Marie Des Georges
-Caroline Guittard
-Jean-Pierre Altiéri
-Carine Templin
