Edtaln : Multiple alignment ------------------------------------------------------------------------------- Le consensus est matrialis par une squence de caractres qui, selon la situation rencontre en une position donne, seront les suivants : "." si le caractre majoritaire a une reprsentation >= 20% ":" si le caractre majoritaire a une reprsentation >= 40% "+" si le caractre majoritaire a une reprsentation >= 60% "*" si le caractre majoritaire a une reprsentation >= 80% le caractre lui-mme, si celui-ci est identique pour l'ensemble des squences. ------------------------------------------------------------------------------- 1 Homo sapiens NP_777367 NCBI 2 Pan troglodytes XP_001144483 '' 3 Macaca mulatta XP_001107584 '' 4 Canis familiaris XP_854563 '' 5 Felis catus ENSFCAP00000009645 Ensembl 6 Bos taurus ENSBTAP00000014972 '' 7 Mus musculus NP_700434 NCBI 8 Rattus norvegicus AAN07149 '' 9 Erinaceus europaeus ENSEEUP00000011971 Ensembl 10 Oryctolagus cuniculus ENSOGAP00000002651 '' 11 Otolemur garnettii ENSOGAP00000002651 '' 12 Cavia porcellus ENSCPOP00000001606 '' 13 Monodelphis domestica ENSMODP00000026597 '' 14 Ornithorhynchus anaatinus ENSOANP00000009522 '' 15 Gallus gallus ENSGALP00000016895 '' 16 Xenopus tropicalis ENSXETP00000043393 '' 17 Gasterosteus aculeatus ENSGACP00000006344 '' 18 Takifugu rubripes SINFRUP00000146223 '' 19 Danio rerio CAM15647 NCBI 10 20 30 40 50 60 1 MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 2 MPSQQKKIIFCMAGVLSFACALGVVTALGTPLWIKATILCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 3 MPSQQKKIIFCMAGVLSFACALGVVTALGTPLWIKATILCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 4 MPNQQKKVVFCTAGVLSFVCALGVVTALGTPLWIKATFLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 5 MPNQQKKVIFCMAGVLSFVCALGVVTALGTPLWIKATFLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 6 MPSQQKKVIFCMAGMLSFMCALGVVTALGTPLWIKATFLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 7 MPSQQKKIIFCMAGVLSFLCALGVVTAVGTPLWVKATILCKTGALLVNASGKELDKFMGE 60 8 MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 9 MPSQQKKVIFCMAGMLSFMCALGVVTALGTPLWIKATFLCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 10 MPSQQKKIIFCTAGVLSFVCALGVVTALGTPVWIKATILCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 11 MPNQQKKIIFCTAGVLSFACALGVVTALGTPLWIRATILCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 12 MSNQQKKIIFCMAGVLSFVCALGVVTALGTPLWIKATILCKTGALLVNASGQELDKFMGE 60 13 MPSQQKKVIFCMAGILSFACSFGVIMALGTQLWVKAKILCKTGALLVNASGQELEKFTGE 60 14 MSSRQKKVIFGVAGLFSFACALGVLAATGTQSWIKGTIFCQTGALLVNASGQELEKFIGE 60 15 MPTPQKKILFCLAGVLSFVCALGTAAAIGTQLWVKGTILCKTGALLVNATGPELEKFIGE 60 16 MPKLQKKILFCLAGVLSFACALSIAAALGKQLWVKGTILCKTAALLVNATEGELHQFVGE 60 17 MPNRQKQILFSVSGVLGFSCALMAAVATGLPFWVTGAVLCRTGAELVNATGAELDKFLGE 60 18 MPSPQKRLVFS-SGLLSFLCALTAAVATGLPSWLSGTVLCRTGAELVNATGAELDKFLGE 59 19 MPTLWKQIVFSFASILSIGSVVLLVVALSTERWVTGTTLCQTGVDLVNASRPELEQFTGH 60 C M*:+*K*++F+:**+***:***++++A+**++W+++*:*C+T***LVNA+*+EL+*F+G* 70 80 90 100 110 120 1 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFM 120 2 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFM 120 3 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFM 120 4 MQYGLFHGEGIRQCGLGARPFRFSLFPDLLKVIPVSIHVNVILFSTILVVLTMVGTAFFM 120 5 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSLFPDLLKVIPLSIHVNVILFSTILVVLTMVGTAFFM 120 6 MQYGLFHGEGVRQCGLGKRPFRFSFFLDLLKAIPVSIHVNVILFSTILIVLTLVGTAFFM 120 7 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLVQAIPVSIHINIILFSMILVVLTMVGTAFFM 120 8 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNIILFSMILVVLTMVGTAFFM 120 9 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPELLKAIPVSIHVSVILFSVILVVLTMVGTAFFM 120 10 MHYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSTILIVLTMVGTAFFM 120 11 MRYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFTFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSTILIVLTMVGTAFFM 120 12 MQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSTILIVLTMVGTAFFM 120 13 IQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLVKTIPVSIHVNIILFSTILIMLTMAGAAFFM 120 14 IQYGLFSGERVRQCGLGGRPFQFSFFPDLLKVIPLSIHVSVILFSIILIVFTLVATAFFL 120 15 IQYGLFHGERVRQCGLGGRPFQFSFFPDLLKIIPASIHVSVILFCMVLIIFTLVGMGFFL 120 16 IQYGLFFGQRVKQCGLGGRPTTFSFFPDLLNVIPASMHVSVIIFSTALIVFALVGTGFFM 120 17 LNYGLFHGQRVKQCGLGGRPSRFSFFPDLLSAIPVVLHVFVIFFCGVVILFSSVVTGFFF 120 18 LSYGLFHGVRVKQCGLGGRASRFSFFSELLTVMPAGLHVTVIFFCGVVILLSSAATGFFF 119 19 IYYGLFQGGKTRRCGLGIRRAKIYIFPKLIKKINSGLHMIIIFFLFTAIGFAVVSLAFCI 120 C ++YGLF*G++***CGLG+R*++***F**L*+:**+*+H*++I+F+:+*+++++*+*+F*+ 130 140 150 160 170 180 1 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKT 180 2 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKT 180 3 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEATYVYKT 180 4 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYAYKT 180 5 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFMSGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANDKEGTYAYKT 180 6 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKLHHLSEKIANYKEGTYAYKT 180 7 YNAFGKPFETLHGPLGLYLVSFISGSCGCLVMILFASEVKVHRLSEKIANFKEGTYAYRT 180 8 YNAFGKPFESLHGPLGLYLVSFISGSCGCLVMILFASEVKIHRLSEKIANFKEGTYAYKT 180 9 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFIAGSCGCLVMVLFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYAYKT 180 10 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLTFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYAYKT 180 11 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYAYKT 180 12 YNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYNEGTYAYKT 180 13 YNAFGKPYETLLGPLGLYLWSFISCSCGCLVMILFASEVKMHHLSEKIANYKEGTFIYKI 180 14 FNAFGKPYETLHGPTGLYFWSFISCTCGCLVMVLFASEVKIHRLSEKIANYKEGTYIYLT 180 15 YNAFGSPYETLHGPVGLYLWSFIACSCGCLIMILFSSEVKIHHLSEKIANFKEKSFTFKT 180 16 FNAFGNPFETLHGPVGLYLWCFVSCSCGCLVLILFSSEVKMHHLSEKIANYKEGSFVFKT 180 17 FNAFGRPYETLQGPLGLYLWSFISWLSSCLVMVLFASEVNIHHLSHRIANFNEVNFVFQT 180 18 FNAFGRPYEMLQGPVGLYLWTSISGLCSCLVLVLFAAEVKLHHLSDRIANFSEVNFTFEA 179 19 YNARKVPYQSIKGPFGLYIWNFIAALFSAMGFACFLAAIQCHKLTEHVANYSESLFTLVI 180 C +NA**+P+***+GP+GLY*:+***++******+*F*****+H+L****AN++E+++:++* 190 200 210 220 230 1 QSEKYTTSFWVIFFCFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-AETTNVAADLMY 232 2 QSEKYTTSFWVVFFCFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-AETTNVAADLMY 232 3 QSEKYTTSFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TETTNVAADLMY 232 4 QSEKYTTSFWVVFICFLVHLLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TETTNVAADLMY 232 5 QSEKYTASFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TETTNVAADLMY 232 6 QSEKYTASFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TETANVAADLMY 232 7 QNENYTTSFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFTKSKE-TETTNVASDLMY 232 8 QNENYTTSFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFTKSKE-TETTNVASDLMY 232 9 QSEKYTTSFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFVKSKD-TETSNVAADLMY 232 10 QSEKYTTSFWVVFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TETANVAADIMY 232 11 QSEKYTTSFWVIFICFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKD-TVTSNVAADLMY 232 12 QNEKYTTSFWVVFICFFVHLLNGLLIRLAGFQFPFSKSKD-AETTNVAADLMY 232 13 HSEKYATSFWVIFICFSMHILNGLLIRLAGFQFPFTKSKD-LET-NTAADLMY 231 14 HSENYASSFWVIFVCSFVHFLNGFLIRLAGFQFPFAKSKD-SETTNGAVDLMY 232 15 HSERFADSFWIILSCSLVHFLNALLIRLAGFEFPFSKPKD-SGTATGAADLMY 232 16 HSEQFQTSYWIILVCTLVHIVNVFLIRVAGFNFPFAKSKD-LETSSGANDLMY 232 17 YTQRYDLCFWLFFLVFLLHGLNFSLIRLAGVQFPFRGGKE-SAPSGGAADLMY 232 18 YREQYDRCFWLFFLIFLIHGLNLGLIRLTGVQFHFHKPKE-LDPSGGAADLMY 231 19 LEENLGFSFWLVVASAVTHGANILVVASSKIHLPKIQTKKPEEPTATGEDFLY 233 C ++*:*++**W+:*:*+++H+*N++***********:*+K+ :+*:++*+D**Y